نرم‌افزار مدیریت اطلاعات بیوبانک (Biobank Information Management System ) و یا به اختصار BIMS برالی داشتن نمونه‌هایی با کیفیت بالا اساسی است. 

نرم‌افزار مدیریت بیوبانک باید قابلیت مدیریت فعالیت‌های مختلف بیوبانک و اطلاعات وابسته به این فعالیت‌ها را تضمین کند. اساساً مهم است که سیستمی برای ردیابی نمونه‌هایی که به بیوبانک وارد می‌شود و مستند کردن عملیاتی که بر روی آن‌ها انجام می‌شود وجود داشته باشد. 

مستندات مربوط به جمع‌آوری نمونه ( مانند رضایت آگاهانه، فرم اطلاعات مشکارت بیمار، پروتکل جمع‌آوری نمونه)، روند آماده‌سازی نمونه، به اشتراک گذاشتن نمونه‌ها (انتقال مواد و اطلاعات) و حمل و نقل (تاییدیه‌های ارسال و تحویل نمونه) می‌بایست به طور مناسب در سیستم قابل مشاهده باشد. به منظور اطمینان از اینکه تمام داده‌های ثبت شده در سیستم به درستی پیگیری و نگهداری می‌شوند و در صورت بروز اشتباه یا اشکال پیش بینی نشده قابل بازیابی هستند، نرم‌افزار بیوبانک باید دارای قابلیت پشتیبان گیری باشد.

قابلیت همکاری بین فناوری اطلاعات و بیوبانک عمدتا چالشی مهم بشمار می‌رود. مثلا لازم است تک تک تقسیمات (الیکوت‌ها) یک نمونه قابل ردیابی باشند. همچنین پایگاه داده باید بلادرنگ و به طور منظم به‌روز رسانی شود تا بتوان ورود و خروج هر نمونه را در درون بیوبانک ردیابی کرد. 

علاوه‌بر این که نرم‌افزار باید در نوع عملیات را در هر بخش بیوبانک ثبت کند، نیاز به راه‌حل‌های نرم‌افزاری برای ثبت اطلاعات در مورد نظارت بر زیرساخت‌های ذخیره‌سازی و گزارش‌ هشدارهای ثبت شده از اشکالات و اختلالات نیز وجود دارد. 

نرم‌افزار مدیریت بیوبانک باید اطلاعات مربوط به ورود افراد، اقدامات انجام شده و انجام دهندگان آن را نیز ثبت نماید.